Black Water, el depredador más letal del océano, regresa, pero esta vez el terror llega a mayores profundidades. Cuando una plataforma petrolífera en el Océano Pacífico perfora accidentalmente una antigua fosa submarina, libera un enorme Megalodón que se ha adaptado a la oscuridad de las profundidades, ganándose el nombre de “Black Water” debido a sus escamas negras y sus aterradoras habilidades de sigilo. A medida que este depredador gigante sube a la superficie, comienza a causar estragos en las ciudades costeras, atacando barcos, submarinos e incluso llegando a aguas poco profundas donde la gente pensaba que estaba a salvo.
Jonas Taylor (Jason Statham) vuelve a la acción, atormentado por sus encuentros pasados con estas criaturas mortales. Junto a un equipo de biólogos marinos y expertos en aguas profundas, Jonas debe enfrentarse a este nuevo y más agresivo Megalodon que puede camuflarse en las aguas oscuras, lo que hace que sea casi imposible rastrearlo. Mientras corren contra el tiempo para evitar que la criatura llegue a una isla densamente poblada, descubren que el Megalodón de Aguas Negras no es la única amenaza que acecha en la fosa: todo un ecosistema de depredadores prehistóricos ha sido perturbado, amenazando con convertir los océanos en un coto de caza. Megalodón 3: Aguas Negras ofrece acción trepidante, intensas batallas submarinas y el enfrentamiento definitivo entre el hombre y el depredador más temible del océano.